Il a suivi une formation universitaire à Paris VIII, section cinéma, et a commencé par réaliser des documentaires.
Parti à Sarajevo en 1992, pendant le siège, il y a réalisé, en collaboration avec des acteurs bosniaques, deux films de fiction (dont Jours tranquilles à Sarajevo, sélectionné à Cannes en 2002).
En 2000, François Lunel a tourné un documentaire sur la vie de cinq marins en mer d’Irlande (Sol en mer, diffusé sur France 3). En 2005, il a réalisé un documentaire sur la vie de Sonny Simmons, saxophoniste américain (soutenu par le CNC).
Il va publier son premier livre (KEREMMA, éditions Riveneuve) et vient de finir deux long-métrages (L’Apparition de la Joconde, Chez Léon Coiffure).
Il écrit un quatrième film de fiction “Les Effarés”.
Il enseigne depuis 2000 la réalisation à la Fémis, à la Faculté de Nancy II, et à Marne la Vallée.